Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CXCL6P80162 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms