Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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