Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANGAP1P46060 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms