Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRPH2P23942 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRPH2P23942 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRPH2P23942 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRPH2P23942 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms