Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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