Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C4BP0C0L5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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