Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCNDBP1O95273 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CCNDBP1O95273 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNDBP1O95273 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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