Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms