Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms