Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEMP2A6NFY4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms