Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms