Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HMG20AQ9NP66 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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HMG20AQ9NP66 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HMG20AQ9NP66 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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