Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC106Q9BWC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms