Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TUBA1CQ9BQE3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TUBA1CQ9BQE3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms