Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD5Q99717 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms