Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AGAP4Q96P64 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AGAP4Q96P64 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms