Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CAVIN3Q969G5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms