Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-CQ95604 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms