Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDAQ92838 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDAQ92838 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDAQ92838 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms