Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf40Q8IXQ3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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