Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00299Q6ZSB3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms