Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms