Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSRP2Q16527 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSRP2Q16527 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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