Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms