Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms