Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP7AQ04656 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms