Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COG7P83436 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COG7P83436 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms