Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIM1P81133 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIM1P81133 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIM1P81133 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms