Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms