Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXD13P35453 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms