Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYT1P21579 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT1P21579 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms