Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB9P17482 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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