Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLA1P09884 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLA1P09884 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLA1P09884 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLA1P09884 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLA1P09884 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLA1P09884 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLA1P09884 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms