Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9P02748 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9P02748 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9P02748 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms