Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TLR5O60602 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TLR5O60602 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms