Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC7A4O43246 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms