Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UBXN8O00124 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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