Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00587B1AMM8 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms