Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKD1Q969G9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms