Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT80Q6KB66 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms