Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EDRF1Q3B7T1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms