Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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