Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CST6Q15828 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CST6Q15828 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CST6Q15828 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CST6Q15828 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms