Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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TUBA3CQ13748 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBA3CQ13748 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBA3CQ13748 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBA3CQ13748 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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