Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE3BQ13370 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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