Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCAPQ12770 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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