Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBRQ0VD83 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms