Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA3Q08378 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA3Q08378 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms