Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCBP4P57723 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms