Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms